デジタルPCR

ナノプレート dPCRアプリケーション

ナノプレートデジタルPCRのトップアプリケーション

高感度、優れた精度、絶対定量によって、デジタルPCRは、存在量の少ないターゲット、複雑な混合物中のターゲット、対立遺伝子変異体を検出し、広範囲のサンプルとアプリケーションにわたって、ターゲットレベルの小さな発現差をモニターできます。 これには以下が含まれますが、これらに限定しません。

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GeneGlobe Design＆Analysis Hubで、デジタルPCRによるDNA、RNA、lncRNAターゲット定量のための最新アッセイを見つけて構成します。

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COVID-19下水テスト

Wastewater
下水の組成は非常に不均一なので、非ターゲット核酸分子混合物から非常に少量のウイルスRNAを同定できるメソッドが確実に得られます。デジタルPCRは、下水中に存在する低濃度のSARS-CoV-2 RNAを高精度で測定でき、qPCRの結果と良好な相関関係を示します。さらに、デジタルPCRは、サンプル中の変異ウイルスに起因する変異体を正確に識別および定量でき、野生型と変異体の両方のゲノムのコピー数を正確に測定することもできます。
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新着！ フランス、モンペリエのI.A.G.E.で行われた最近の研究について読む
著者らは、非侵襲性のヒト唾液サンプル中のSARS-CoV-2変異体を正確に高頻度で検出するために、qPCRの代わりにQIAcuityデジタルPCRメソッドを使用することに成功しました。
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まれな突然変異検出

ターゲット定量は増幅サイクル数に依存しないため、デジタルPCRにより、まれなイベント／配列変異体の検出と絶対定量の感度が上昇します。さらに、分割により、野生型バックグラウンドプールで低頻度ターゲット（対立遺伝子変異体、SNP）を検出するとき、信号対ノイズ比が上昇し、偽陽性率が低下します。

まれな突然変異検出のためのデジタルPCRの新たな用途は、次のとおりです。

  • 現在の検出レベル以下の残存がんの同定
  • がんの新たな突然変異と重複の検出
  • まれな薬剤耐性突然変異のモニタリング
Rare mutation

コピー数多型

Copy variation

デジタルPCRは、標準曲線を必要とすることなく、4コピーから5コピーへのCNVの1.2倍未満の変化などの小さな発現差を簡単に検出できます。このテクノロジーの精度と感度により、システムはコピー数の微妙な変化を区別できますが、増幅効率の変化や阻害物質の存在に対して精度はあまり高い感度を持ちません。コピー数多型に対するデジタルPCRの新たな用途として、がん研究（がんバイオマーカーのスクリーニングとモニタリング）、神経学的症状の研究、集団研究の分野があります。

デジタルPCRのヒントとコツ

ゲストウェビナーからの洞察に満ちた回答と、上位20個の質問をまとめましたのでご覧ください。

遺伝子発現解析

デジタルPCRの精度の向上により、遺伝子発現解析の多くの局面でより高い解像度を提供できます。そのため、発現差が2倍未満であっても、発現レベルの小さな変化をモニターできます。デジタルPCRは、まれなターゲットの定量や非常に限られた出発物質からRNAを定量するときにも、高い感度が得られます。

遺伝子発現解析へのデジタルPCRの新たな用途は次に示すとおりです。

  • メチル化イベントの研究
  • 転写レベルの定量化
  • miRNAレベルの変化測定
gene expression analysis

細胞および遺伝子治療

group of dividing cells

デジタルPCRは、ウイルス力価およびベクターコピー数の測定、遺伝子およびCAR T細胞治療の開発と製造を含む、広範囲な細胞および遺伝子治療アプリケーションを可能にします。また、自信を持って治療製品の品質を検証するのに役立ちます。これは、患者の安全を確保しながら、効果的で再現性のある遺伝子治療を開発する場合に重要です。 

QIAcuity dPCRがウイルス力価定量の速度、スループット、精度をどのように向上させ、アッセイをqPCRからdPCRに移行するのがいかに容易で、一貫した結果を提供できるかご覧ください。

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お客様の声
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お客様のご意見

イェーテボリ大学分子臨床医学部のスウェーデン肥満被験者（Swedish Obese Subjects（SOS））研究の研究者兼コーディネーターであるDr. Johanna Andersson-Assarssonは、「コピー数が多く、バラツキが非常に大きい遺伝子の場合、定量的PCRでは解像度は十分ではありません」と述べています。Andersson-Assarsson博士は、デジタルPCRは、その解像度のおかげで、コピー数解析分野で若干革命的であると述べています。良い結果が得られるデジタルPCRにはさまざまなソリューションがありますが、QIAcuityシステムで私が気に入っているのは、シンプルで迅速なワークフローであり、プロセスで使用するプラスチック製のチップやプレートの量が少なく、環境にやさしいことです。

「私たちは環境DNA（eDNA）を使用して、海洋沿岸の生態系の種の分布を調査しています。デジタルPCRは、低いDNA濃度で高い検出率を示し、このような生態系に存在する高濃度のPCR阻害物質を処理できます。最近、QIAGEN dPCRプラットフォームであるQIAcuityを発注しました。特に容易で迅速であることがわかったからです。増幅効率に関係なく、外来種のeDNAをより正確に、かつ高感度で定量できます」とスウェーデン、イェーテボリのSeAnalytics ABのCEOであるPer Sundbergは述べています。
「新しいハイスループットQIAcuity Eightを使用する試験では、下水サンプルからSARS-CoV-2の新変異株の検出に成功しています」と、モンペリエ（フランス）のI.A.G.Eの社長であるDr. Franz Durandetは述べています。「QIAGENの迅速でスケーラブルなこのテクノロジーにより、当社は今後、さらに付加価値の高い環境・生物学的検査サービスを顧客に提供してゆくことができます。」
dPCR, Nicole Masters, John Spear, QIAcuity, customer testimonial, Colorado School of Mines
“「微生物バイオマス濃度が低い場合、qPCRは定量に適したツールですが、dPCRが最良のアプローチです。QIAcuity dPCR装置を使用すると、土壌、岩石、水中の微生物を一貫して検出・定量できます」”と米国コロラド州コロラド鉱山学校の土木環境工学科のJohn R. Spear教授は述べています。
写真：Nicole Masters、大学院生
“「私たちのラボでは、さまざまなサンプル由来のターゲットの絶対定量にQIAcuityデジタルPCRシステムを喜んで使用しています。ワークフローは単純で、習得が容易で、信じられないほど一貫性のある結果が高感度で得られます」”とノースカロライナ大学チャペルヒル校（UNC）のDrew Capone （中央）と同僚たちは述べています。
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