QIAGEN Clinical Insight (QCI) Analyze

QCI Analyze は、GeneReader NGS System 上でGeneRead QIAact Panels を用いたNGS データ解析を行なう際に、必要なすべてのツールを提供します。QCI Analyze は、シークエンシング反応のセットアップからシークエンシング結果の自動解析まで、GeneReader に完全対応しています。ソフトウェアは、最適化ずみのリードアライメント、変異コーリング、フィルタリング、統合化された表示画面システムを含み、実験結果の解析における確実性を研究室で確認できます。QCI Analyze で品質管理（QC）レポートおよび変異データをレビューした後、QCI Interpret で変異解釈を継続します。

QCI Analyze は、ブラウザをベースにしたインターフェイスで、QIAGEN GeneReader と共にNGS データを解析し、インスペクションとエクスポートのため結果を表示します。QCI Analyze には CLC Genomics 環境で作成されたワークフロー(GeneRead QIAact Actionable Insights Tumor Panel ワークフロー) がインストール済みで、QIAGEN 製品として購入できるGeneRead QIAact Actionable Insights Tumor Panel に特異的なものです。本キットは、生物学的、臨床的に関連する疾病にフォーカスした遺伝子のパネルから、エクソン領域を増幅するためのマルチプレックスPCRプライマーセットです。それに伴うワークフローは、相当するターゲット領域、目的の領域および目的の変異をインプットします。 複数のユーザーが、自分のブラウザからデータにアクセスでき、NGS データにアクセスするために各コンピュータにソフトウェアをインストールする必要はありません。解析を管理、合理化することができ、すべてのユーザーのアクセスをサンプルベースで追跡できます。QCI Analyze の背後ではCLC Genomics Server が作動し、解析、データ保存、キューイングなどの様々なプロセスを処理しています。 QCI Analyze プラグインは、GeneReader によりシークエンシングデータが作成されるとすぐにその解析を自動的に開始し、QCI Interpret への接続を実現します。

QCI Analyze ワークフロー

QCI Analyze ワークフローは、GeneReader で作成された次世代シーケンス（NGS）データの合理的で標準化された解析を実現します。ワークフローは自動化され、より高い標準化およびより正確な結果を確保します。QCI Analyze プロセスを以下に示します:

• 作成および解析されたデータの品質が、指定した基準に合致していることを確認する品質管理
• GeneReader で作成されたシークエンシングファイル（FASTQ files）から解釈可能な結果へ転換するために最適化されたリシーケンシング工程
• 可視化によりシーケンス中の変異のレビューと確認が可能

ワークフローは以下の項目を含むウェブでアクセス可能なインタラクティブなレポートを作成：

• 結果の要約
• 遺伝子および変異レベルの統計
• 詳細なQC
• データ処理追跡記録
• 変異の可視化表示用のトラッキングリスト

管理者オプションは、一般ユーザーにはワークフローをロックするというように、変異レポーティングを研究室独自の基準に設定できます。

QCI Analyze は、GeneReader のような自動シークエンサーにより作成されたデータの解析をするための二次解析ソフトウェアです。