AllPrep PowerFecal DNA/RNA Kit

ゲノムとトランスクリプトーム情報を信頼性高く比較するには、同一サンプルからのDNA とRNA の精製が不可欠です。 AllPrep PowerFecal DNA/RNA Kit プロトコールを使用すると、1 つのサンプルから別々の溶出液でDNA とRNA を同時に分離精製することができます。 このキットは、次世代シークエンシング（NGS）を用いたメタゲノムおよびメタトランスクリプトーム解析に使用するために至適化されています。

AllPrep PowerFecal DNA/RNA Kit は、大量にPCR 阻害物質を含む糞便からDNA とRNA を効率的に精製します。阻害物質を除去することは、PCR またはNGS 解析において良好な結果を得るために大変重要です。AllPrep PowerFecal DNA/RNA Kit には、特許取得済みの阻害物質除去技術（IRT）が付属しています（図 “ 阻害物質除去”）。IRT は、消化された食品、便中の溶解した赤血球由来のヘムおよび他のPCR 阻害物質の完全な除去を行なえます。AllPrep PowerFecal DNA/RNA Kit は、改良されたMicrobial Lysis Tubes を使用して、糞便からDNA とRNA の両方を高い収量で得ることが出来ます。得られたDNA およびRNA は、微生物のOTU (Operational Taxonomic Unit) 解析、またはメタゲノムとメタトランスクリプトーム解析の比較研究などのNGS 解析に適しています（図 “ 異なる糞便サンプルを用いたOTU (Operational Taxonomic Unit) 解析”）。

AllPrep DNA/RNA FFPE Kit は、同一糞便サンプルからのゲノムDNA とトータルRNA の同時精製が可能です。それと比較し、他の手法では、サンプルを2 つに分けてそれぞれからDNA とRNA の精製を行ないます。DNA とRNA を異なる個体群の細胞から精製することとなり、いかなるダウンストリーム解析においてもバイアスが生じることになります。本キットを用いると、高純度のDNA およびRNA を同一サンプル全体から得ることが可能です。

シンプルなワークフローにより、同じ糞便サンプルから高品質なDNA およびRNA を精製することができます（図 “ AllPrep PowerFecal DNA/RNA Kit の操作手順”）。 糞便サンプルを、予めビーズが充填済みのLysis Tube を用いて、化学的および機械的に溶解とホモジナイズを行ないます。 次いで、糞便サンプル中に通常存在する阻害物質を核酸の精製前に除去します。 処理された液をAllPrep DNA MinElute Spin Column にアプライし、最初にゲノムDNA がシリカメンブレン上に結合し、RNA 分子はフロースルーへ通液されます。 このフロースルーを、RNA が選択的に結合するRNeasy Mini Spin Column で精製します。 結合したDNA およびRNA をそれぞれ洗浄し、溶出して高純度な核酸を得ます。 必要に応じて、オプションでon-column DNase およびon-column RNase 処理を行ない、それぞれにクロスコンタミネーションしている核酸をさらに排除することができます。

AllPrep PowerFecal DNA/RNA Kit は、特許取得済みのIRT 技術とビーズ破砕ステップを用いて阻害物質を除去し、微生物細胞を効率的に溶解するように至適化されています。 AllPrep PowerFecal DNA/RNA Kit で得られたDNA とRNA は、16S rDNA プロファイリング、メタゲノムショットガンシークエンシングとメタトランスクリプトームプロファイリングの比較などのNGS 対応アプリケーションでの使用に適しています。