FFPE-Ressourcenzentrum

Serie „FFPE im Fokus“

Wissenschaftler von QIAGEN teilen ihr Fachwissen

Die rund um den Globus vorhandenen Archive formalinfixierter, Paraffin-eingebetteter (FFPE-) Gewebeschnitte stellen eine wertvolle und umfassende Materialquelle für die biomedizinische Forschung dar. FFPE-Gewebe ist ein wertvoller, aber auch anspruchsvoller Probentyp, der für die Analytaufreinigung und nachgelagerte molekulare Analyse hocheffiziente Methoden erfordert, welche mit der Natur von FFPE-Proben kompatibel sind. Registrieren Sie sich für unsere „Tipps und Tricks“-Reihe und profitieren Sie von der Expertise der Wissenschaftlicher bei QIAGEN.

Stimmen Sie ab und erkennen Sie Trends

Das Erkennen von Trends in der Krebsforschung kann helfen, unser Wissen auszubauen und das Feld weiter voranzubringen. Teilen Sie in unseren Live-Abstimmungen Ihre Meinung zu hochaktuellen Themen und sehen Sie direkt die Ergebnisse an. Halten Sie auf unseren Community-Seiten Ausschau nach ihnen und melden Sie sich bei uns, sollten Sie eine Idee für eine neue Abstimmung haben:

Norbert Hochstein: Methylierungsanalyse mittels Pyrosequenzierung – Einfluss von Amplifikatlänge und der eingesetzten DNA-Menge

Norbert gibt einen Überblick über einen Pyrosequenzierungs-Workflow zur Methylierungsanalyse und spricht anschließend über die wesentlichen Ergebnisse seiner Pyrosequenzierungsstudie unter Einsatz von FFPE-Proben und den Einfluss von Amplifikatlänge und eingesetzter DNA-Menge auf die Ergebnisse.

Francesca Di Pasquale: miRNA-Analyse mittels PCR

Francesca spricht über häufige Herausforderungen bei der Arbeit mit miRNA aus FFPE-Proben und die wichtigsten Erwägungen für Primerdesign, Qualitätskontrolle und Datennormalisierung für die miRNA-Expressionsanalyse mittels qPCR.

Marie-Louise Lunn: miRNA-FFPE-ISH bei der Entwicklung von Krebs-Biomarkern

Marie-Louise stellt eine optimierte Methode zur In-situ-Hybridisierung von miRNA für Lokalisierungsstudien unter Einsatz verbrückter Nukleinsäuren (Locked Nucleic Acids, LNAs) vor. Dabei spricht sie über ein optimiertes, ungiftiges, eintägiges Protokoll zur ISH-Optimierung, einschließlich der nötigen Kontrollen.

Jonathan Shaffer: Gesamttranskriptom-NGS von FFPE-Proben

Jon stellt eine neue Technologie zur effizienten Entfernung von rRNA aus FFPE-Proben bei der Gesamttranskriptom-RNA-Sequenzierung vor, welche die Zahl der Genen zugeordneter Reads und erkannter Gene drastisch erhöht und so eine robuste differenzielle Expressionsanalyse ermöglicht.

Jonathan Shaffer: Multimodale NGS-Analyse auf Basis von FFPE-Proben

Jon stellt einen neuen Workflow – multimodale NGS – für das gleichzeitige Profiling von DNA-Varianten und RNA-Fusionen vor. Anhand von Beispielen erläutert er, wie diese Lösung eine konsolidierte, gezielte DNA- und RNA NGS library Erstellung aus FFPE-Proben ermöglicht.

Leif Schauser: NGS-Datenanalyse unter Einsatz der QIAGEN CLC Genomics Workbench

Leif stellt die QIAGEN CLC Genomics Workbench für die Analyse von NGS-Daten sowie die für FFPE relevanten Schlüsselmerkmale vor. In einer Live-Demo führt er durch die wesentlichen Schritte der Workflows zur DNA-Seq- und RNA-Seq-Datenanalyse.

Erfolgreiches Biomarker-Profiling anhand von FFPE-Proben

FFPE-Gewebeschnitte stellen einen wertvollen, aber anspruchsvollen Probentyp dar, bei dem hocheffiziente Methoden zur Analytaufreinigung und für die nachgelagerte molekulare Analyse erforderlich sind.
Erfahren Sie mehr über die neuesten Methoden und kritischen Erwägungen in Bezug auf die Präparation von FFPE-Proben und die präanalytischen Schritte für die molekulare Analyse.

Entdecken Sie das wahre Potenzial von FFPE-Proben

Entdecken Sie die Sample to Insight Lösungen von QIAGEN für die erfolgreiche molekulare Analyse von FFPE-Proben – von der Probenvorbereitung bis zur Datenanalyse, für die molekulare Analyse mittels NGS, digitaler PCR, PCR oder qPCR.

Produkt im Fokus: 

QIAamp DNA FFPE Advanced Kit

Dieses zukunftsweisende Kit zur Isolierung von DNA aus FFPE-Gewebeproben hilft Ihnen, Ihren Ertrag an amplifizierbarer DNA zu steigern. Das Xylen-freie Protokoll mit Entparaffinierung ohne Waschschritt und doppelter Lyse kann auch automatisiert werden.