Sample to Insight workflow
Mikrobiom

„Sample to Insight“-Workflow

Erstellen Sie Ihren kompletten Workflow für die Mikrobiomforschung

Die Mikrobiomforschung erfordert die Analyse unterschiedlichster Proben. Zuverlässige Ergebnisse und aussagekräftige Erkenntnisse zu erhalten, kann eine Herausforderung sein. Machen Sie das Beste aus Ihren wertvollen Proben und nutzen Sie die einzigartigen Lösungen von QIAGEN für Ihren gesamten Workflow, von der Nukleinsäureisolierung bis zur Datenanalyse und -interpretation. Um Ihnen den Weg durch das breite Spektrum an Lösungen und Anwendungen zu erleichtern, haben wir eine Schritt-für-Schritt-Anleitung für Ihren gesamten Workflow erstellt.

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Unser Team hilft Ihnen gerne weiter
Sprechen Sie uns gerne an, wenn Sie Fragen zum Workflow und zu unseren Produkten haben.
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Proben für die Mikrobiomforschung stellen häufig eine Herausforderung dar, da sie schwer zu lysieren sind. Mikroben können eine wiederstandsfähige extrazelluläre Matrix aufweisen. Die unvollständige Lyse einer mikrobiellen Gemeinschaft führt zu einer ungenauen Darstellung des mikrobiellen Probeninhalts.

Um die Einführung systematischer Fehler während der Zelllyse zu vermeiden, wird die mechanische Homogenisierung empfohlen.. Die Lösungen von QIAGEN für den Probenaufschluss gewährleisten eine rasche, leistungsstarke und effiziente Homogenisierung, die eine Voraussetzung für reproduzierbare Ergebnisse ist.

Produktgruppen 
Entdecken Sie Produkte zur Homogenisierung für den Aufschluss von Mikrobiomproben

Human biomedical research

Für die biomedizinische Forschung am Menschen

Bei der Isolierung von DNA und RNA stellen unterschiedliche Materialquellen vielfältige Herausforderungen dar. Die Kits von QIAGEN für die biomedizinische Forschung am Menschen sind für bestimmte Probentypen, wie Darmgewebe, Stuhl, Abstriche und mehr, optimiert. Die patentierte Inhibitor Removal Technology® (IRT) beseitigt Inhibitoren während der Aufreinigung. Das Ergebnis ist eine hohe Ausbeute an reinen Nukleinsäuren, die auch in anspruchsvollen nachgeschalteten Anwendungen genutzt werden können.

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Entdecken Sie Produkte zur Vorbereitung von biomedizinischen Proben des menschlichen Mikrobioms

Sample preparation ENV AGR

Für Umwelt- und Agrarforschung

Unterschiedliche Materialquellen stellen unterschiedliche Anforderungen an die DNA- und RNA-Isolierung. QIAGEN-Kits für die Umwelt- und Agrarforschung wurden für bestimmte Probentypen optimiert, z. B. für Boden, Wasser, Biofilm, Pflanzen und mehr. Die patentierte Inhibitor Removal Technology (IRT) beseitigt Inhibitoren während des Aufreinigungsprozesses. Das Ergebnis ist eine hohe Ausbeute an hochwertigen, reinen Nukleinsäuren, die selbst für die anspruchsvollsten nachgeschalteten Anwendungen genutzt werden können.

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Entdecken Sie Produkte für die Prozessierung von Mikrobiomproben für die Umwelt- und Agrarforschung

Service für die DNA-Isolierung aus jeder Art von Probe
Von der Extraktion und Quantifizierung bis hin zu NGS und Analyse, unter Einsatz modernster Technologien.
NGS analysis

Die Verfahren des Next Generation Sequencing (NGS) haben die Erforschung des Mikrobioms revolutioniert. NGS ermöglicht die gleichzeitige Analyse tausender Arten innerhalb einer mikrobiellen Gemeinschaft.

Die Auswahl der Reagenzien und Primer spielt eine große Rolle bei der Erstellung einer geeigneten NGS-Bibliothek, die die systemische Messabweichung minimiert und die Lesetiefe maximiert. Um eine gleichmäßige Abdeckung und hohe Lesequalität zu erreichen, bietet QIAGEN verschiedene Kits für die unterschiedlichsten Amplifikations- und Sequenzierungsbedingungen an.

NGS für das Mikrobiom
Glanzlichter

Produktgruppen
Entdecken Sie NGS-Produkte für die Mikrobiom- Forschung 

Microbiome Profiling Service für anspruchsvolle Proben
Next Generation Sequencing und Analyse der 16S/ITS-Region mit Hilfe modernster Technologien.
Digital insights
Eine exzellente Software-Suite trägt wesentlich dazu bei, dass die Interpretation von Metagenomik-Daten nicht mehr lästig ist, sondern Spaß macht. Werkzeuge und Funktionen, die alle Ihre Bedürfnisse abdecken, von der Taxonomie bis zur Polymorphismusanalyse, bieten die Möglichkeit, aus komplexen Daten wertvolle Erkenntnisse zu gewinnen. Die Bioinformatik-Lösungen von QIAGEN für das Mikrobiom sind anwenderfreundlich. Mit ihrer intuitiven Benutzeroberfläche können sich die Forscher auf das konzentrieren, was wirklich wichtig ist.

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Entdecken Sie digitale Erkenntnisse für die Mikrobiomanalyse

Häufig gestellte Fragen zu Methoden der Mikrobiomforschung

Was versteht man unter 16S und ITS rRNA-Sequenzierung?

Die gängigste Methode zur Erstellung von Profilen mikrobieller Gemeinschaften ist die Sequenzierung des 16S ribosomalen RNA-Gens (rRNA) und der Internal Transcribed Spacer (ITS)-Regionen für Bakterien bzw. Pilze. Aufgrund ihrer universellen Verbreitung und ihres konservierten Charakters sind die 16S rRNA- und ITS-Gene gut etablierte genetische Marker, die zur Identifizierung und Klassifizierung von Bakterien und Pilzen genutzt werden.

Das 16S-rRNA-Gen umfasst sowohl äußerst konservierte als auch hypervariable Regionen. Die konservierten Regionen dienen als Primer-Bindungsstellen für die PCR-Amplifikation der variablen Regionen, und die variablen Regionen enthalten Sequenzen, die zur bakteriellen Identifizierung und Klassifizierung verwendet werden können.

Was versteht man unter metagenomischer Shotgun-Sequenzierung?

Im Gegensatz zur 16S rRNA- und ITS-Sequenzierung erfasst die metagenomische Shotgun-Sequenzierung das gesamte Genom aller in einer Probe vorhandenen Organismen.

Die metagenomische Shotgun-Sequenzierung erfasst die gesamte genetische Information einer Probe; daher können die Daten für verschiedene Analysen genutzt werden, z. B. für die metagenomische Assemblierung und das Binning, die Erstellung von Stoffwechsel-Funktionsprofilen und die Erstellung von Genprofilen die Aufschluss über eine mögliche Antibiotikaresistenz.geben.

Was ist Metatranskriptomik?

Die Metatranskriptomik untersucht das gesamte Genexpressionsprofil mikrobieller Gemeinschaften in natürlichen Lebensräumen. Sie ermöglicht die Quantifizierung der Genexpression und die Erfassung deren Veränderungen als Reaktion auf verschiedene Bedingungen, z. B. die physiologischen und pathologischen Bedingungen in einem Organismus.